شرکت دهکده سبز بخشهای گوناگونی در خود دارد.
در راس مجموعه شورای راهبری قرار گرفته است.
پس از آن مدیرعامل شرکت مسئولیت تمامی اقدامات را بر عهده دارد.
در ذیل مدیر عامل شورای نخبگان ، معاونتهای تحقیق و توسعه ، بازاریابی و فروش ، تبلیغات ، مالی ، فنی ، نیروی انسانی ، تاسیسات و تامین قرار گرفته اند.
هر معاونت یا بخش با زیر مجموعه خود بصورت ساختارمند مرتبط بوده و در برخی موارد نیز از امکانات سایر شرکتها بصورت همکاری و یا برون سپاری استفاده می گردد.
